锅炉除尘器的运转可分为试运转与日常运转。首先进行试运转时，必须对系统的单一部件进行检查，然后作适应性的运转，并要做部件性能试验，在日常的运转中，仍应进行必要的检查，特别是对布袋除尘器的性能检查，要注意主机设备负荷的变化会对除尘器性能产生的影响。在机器开动之后，应密切注意锅炉除尘器的工作状况。
在布袋除尘器试运转时应该注意：
1、风机的的旋转方向、转速、轴承的振动以及温度。
2、处理风量和各测试点压力与温度是否与设计相符。
3、清灰周期及清灰期间的调整。
4、除尘滤袋的安装情况，在使用后是否有掉袋、松口、磨损等情况发生。
5、要注意袋室结露情况是否存在，排灰系统是否畅通。
日常运转时应该注意：
1、运转记录，每个通风除尘系统都要安装和备有必要的测试仪表，在日常运行中必须定期进行测定，并准确地记录下来。
2、气流的阻力，U型压差计可用来判断运行情况：如压差增高，意味着滤袋出现堵塞、滤袋上有水汽冷凝、清灰机构失效、灰斗积灰过多以致堵塞滤袋、气体流量增多等情况。
3、应该安全，袋式除尘器要特别注意采取防止燃烧、爆炸和火灾事故的措施。